Hola Laura,
Sobre como se cargan los CUD y su asociación en el sistema, en nuestra wiki tenemos información al respecto, en el siguiente link podran verlo. Preguntas frecuentes Wiki Pilagá.
Por otro lado, te comento que desde la versión 3.1.1 esta disponible el listado de CUD desde la siguiente opción de menú : Rendición cuentas / Rendiciones SITRARED / Consultas y Listados / Listado de Códigos UD .
Cualquier consulta estamos a su disposición.
Saludos.