Hola Claudio,
estas usando un evento del mismo cuadro para hacer la exportacion?.. un evento en el ci con el servicio vista-excel?.
Algo que este interfiriendo con el metodo conf del cuadro durante la exportacion?
Podes incluir un echo en dicho metodo a ver si se rompe el formato excel?.. .como para verificar que esta pasando por alli.
Saludos