Natalia, en la ultima publicacion de los scripts de esta operación, el procedure sp_araunom_datpers esta modificado, fijate que tiene unos MAX() (que justamente es para resolver este problema de registros duplicados con misma fecha) que no es la version que vos tenes:
-- El alumno no se reinscribió en el año académico informado.
IF vc_FechaReins IS NULL THEN
-- INFORMO QUE NO SE DISPONE DE INFORMACION
-- Busco el Dato Censal correspondiente a la reinscripción.
ELSE
SELECT MAX(sga_datos_censales.fecha_relevamiento), MAX(sga_datos_censales.fecha_actualiz)
INTO vc_FechaDC, vc_FechaAct
FROM sga_datos_censales
WHERE sga_datos_censales.unidad_academica = pUA
AND sga_datos_censales.nro_inscripcion = pNroInscripcion
AND ((sga_datos_censales.fecha_relevamiento = vc_FechaReins) OR (sga_datos_censales.fecha_actualiz = vc_FechaReins));
END IF;