Entonces no se corrio el script que carga esas tablas
El script que carga estas tablas es \02_Modulos\86_Encuestas\02_Migracion\01_tablas_conversion.sql
Aunque… si fallo al cargar la tabla gde_formularios, es decir el script 7 de ese modulo, puede ser que como Kettle vuelve atras todo lo ejecutado hasta ese momento, entonces vuelven a quedar vacias estas tablas de conversion de pk que se corrieron en el script 1.
Proba agregar al final en el FROM del SELECT del script 7 lo siguiente:
JOIN gde_habilitaciones as hab_g3 ON hab_g3.habilitacion = cnvhab.habilitacion
Luego de esto volve a migrar este modulo. Quizas no de error ahora, pero por algun motivo no se esta insertando la habilitacion nro 1, que corresponde a un alcance de encuesta en Guarani 2.