Buenos días Mauro,
no se cómo están haciendo esa transformación de la que hablan pero te comento algunas cosas para ver si les sirve, ya que parece demasiado tiempo el que comentas que tarda para relacionar los datos.
En la tabla sge_elemento, el campo elemento_externo almacena justamente un id correspondiente al sistema que dió de alta ese elemento en Kolla. Por lo tanto si las encuestas las están manejando desde Guaraní y están usando los elementos, allí tendrás el id que corresponda a un id en Guaraní sobre lo que están evaluando.
En el tópico del foro que te mencionó Alejandro en el mensaje anterior él mismo explica con qué datos de Guaraní se corresponden esos ids de acuerdo a la encuesta que están usando desde Guaraní.
Saludos.