Hola Horacio,
si el punto 4 de esa guia se ejecuto correctamente, te deberia haber quedado en <path proyecto Guaraní>/bin un symlink al lanzador de comandos de Toba que se encuentra dentro de la carpeta vendor.
Si no esta dicho symlink, probablemente el punto 4 no termino como debia o hay algo que falta en el composer.json para garantizar que dicho symlink se cree.
Si no esta el symlink, lo que podes hacer es lo siguiente:
ln -s <path proyecto Guaraní>/vendor/siu-toba/framework/bin/toba <path proyecto Guaraní>/bin/toba
Y crearlo manualmente, como workaround sale andando… pero habria que descubrir por que motivo no lo creo al ejecutar composer install y si quedo algo mas pendiente.
Saludos