Hola Javier,
El mismo procedimiento te referis a utilizar arai-registry, instalar arai-documentos y que quede ahi registrado. En principio si, lo que quizá pase es que otros sistemas no estén consumiendo arai-documentos y tengas que simplemente configurarlos manualmente (poner la url de arai-documentos en ese sistema, los user/pass del lado de arai-documentos, etc).