Buenos días,
Seguí los pasos mencionados en la documentación de "actualización del entorno de desarrollo con personalizaciones" (https://documentacion.siu.edu.ar/wiki/SIU-Guarani/version3.18.0/actualizacion_con_personalizaciones/gestion). Aunque, también actualmente instalé una versión "limpia" descargando todo por svn e instalando con composer y yarn, y ese es el único problema hasta ahora (aunque falta probar algunas cosas aún).
La verdad que no se que pudo haber sido. Es raro porque en la versión 3.17.1 nos funciona perfectamente!
Saludos y gracias!.