Hola Jhon,
si el error sigue siendo que no encuentra la URL, debes revisar la configuracion de Apache, yo miraria que no se esten superponiendo alias, etc… si viniera por otro lugar el error deberia ser distinto.
Un detalle, dentro de la carpeta (instalacion/i__nombre_instancia/p__toba_referencia/rest/logs) deberias tener un listado de archivos de logs donde se explique que paso si es que fuera otro el problema.
Saludos