Hola Paola,
Efectivamente lo recomendable es correr el worker utilizando alguna herramienta que facilite la ejecución del mismo.
Supervisor es una opción que hemos probado pero pueden utilizar la que deseen. En este enlace (http://supervisord.org/running.html#adding-a-program) se encuentra la documentación para agregar un servicio a supervisor. Una vez que lo instalen pueden agregar un archivo de configuración (Por ejemplo /etc/supervisor/conf.d/diaguita-worker.conf) con la especificación para ejecutar el worker.
Te dejo un enlace a la documentación del otro worker de Diaguita utilizado en la interacción con arai-documentos (https://expedientes.siu.edu.ar/docs/next/diaguita/#worker-de-documentos). Allí van a poder ver un ejemplo de como realizar el archivo de configuración. Tengan en cuenta que el comando del worker es distinto pero les va a servir como ejemplo. El comando que deben usar es toba proyecto iniciar_workers .
Saludos.