Hola Lucia, como estas?
Te adjunto un link de la documentación de Mapuche, donde se detalla los pasos a seguir para realizar la conexión de Mapuche con el sistema Pilaga:
https://documentacion.siu.edu.ar/wiki/SIU-Mapuche/Version3.10.0/Documentacion_de_las_operaciones/comunicacion/sistemas_siu/siu_pilaga
Si pudieron realizar la importación de las tablas presupuestarias no deberían tener problemas de conexión con la exportación, porque se utiliza el mismo archivo de configuración.
Te hago una consulta, ustedes para corroborar que la importación fue correcta observaron el contenido de las tablas que se modifican en la BD?
Por ejemplo durante la importación, se realiza el borrado y posterior llenado de las tablas dp18 (unidad), dp19 (subunidad), subsubde y dh27 (Tabla de Red Programatica) con los correspondientes datos, si la importación no se completo correctamente estas tablas quedan vacías.
Saludos, Timoteo.