Hola Javier,
El error es porque a partir de Huarpe 2.2 el bundle Mapuche esta separado de Huarpe en sí. Podes editar el archivo app/config/bundles.yml y eliminar la entrada ahi, para poder continuar con la actualización.
Luego de actualizar, podes realizar los pasos para agregar Huarpe (en la doc/bundles está los pasos).
En futura versión de Huarpe, vamos a mejorar esto nuevamente. Saludos!