Hola Sebastián,
Buscá el archivo ‘instalacion/i__desarrollo/global/datos.sql’. Editalo y borrá todos los INSERTS a la tabla ‘apex_checksum_proyectos’ (están en las últimas líneas del archivo y hay uno por cada proyecto). Guardá los cambios.
Después de esto volvé a ejecutar el comando de regeneración de la instancia (toba instancia regenerar).
Saludos, Florencia.