Hola Silvio,
lo que esta diciendo el mensaje de error es que falta un punto de montaje, no que esta duplicado el mismo.
Si estan desarrollando desde varias PCs, fijate que el archivo que esta en el servidor contenga la union de todos los desarrollos, sino va a fallar.
El archivo en cuestion es:
$toba_dir/proyectos/$proyecto_nombre/metadatos/tablas/apex_puntos_montaje.sql
Si el archivo que tienen en el servidor no contiene el punto, mientras los que tienen en las PCs si… entonces o falto subirlo, o se sobreescribio.
Saludos