Hola, suele pasar ese error. Tenes que revisar el archivo instalacion/i__desarrollo/global/datos.sql y borrar (o comentar) las lineas que tienen insert del tipo apex_checksum_proyectos. Después proba correrlo nuevamente. Te dejo este post como referencia: http://foro.comunidad.siu.edu.ar/index.php?topic=6825
Saludos!