Hola Pablo
No hay ningún inconveniente en tener algunas UA usando importación por transferencia y otras por archivo en este caso dado que son bases independientes. Por cada UA que use transferencia (en realidad por cada base de datos) cargamos en SIDCer una conexión distinta (una url con sus credenciales) y el sistema se ocupa de buscar en cada una el DNI ingresado, si hay más de una. El resto puede seguir importando por archivo como siempre. Incluso en la misma UA podrían importar por archivo algunos egresados y por transferencia otros.
Desconocemos por qué desapareció la exportación de archivos desde Guaraní, en todo caso consultales.
La documentación para usar los webservices está en este mismo foro:
https://foro.comunidad.siu.edu.ar/index.php?topic=18320.0Para los usuarios no hay diferencia entre una solicitud importada por archivo o por transferencia (y tampoco si cargan todo manual). Además en todos los casos van a tener que cargar en manualmente algunos datos que no vienen en la importación para poder enviar.
Saludos
Guillermo