Hola Roberto,
en gral venimos desarrollando en LATIN1(8859-1) ya que manejamos todo en ese encoding, msg, sql, etc, de hecho el charset que se especifica al browser es este mismo.
Si pudo haber pasado que alguien justo estuviera usando otra codificacion y haya comiteado algun cambio en otro encoding, pero por el momento la idea es que este en LATIN1. Si me podes pasar los lugares donde te esta pasando esto te lo agradeceria asi lo corrijo para la proxima version de la 2.7.
Saludos