Ningun problema
Puede que cambie un poco depende como lo tengas configurado pero basicamente es apuntar el DocumentRoot de guarani.unca.edu.ar al directorio del Alias
Algo asi
Alias guarani/3.11 /donde/lo/tengas/instalado
<VirtualHost *:80>
ServerName guarani.unca.edu.ar
DocumentRoot /donde/lo/tengas/instalado