Hola Pablo,
te pido si nos podés adjuntar los logs, tanto de Guaraní como de Apache, para poder verificar los errores y cómo se está cargando el combo en cascada.
Con qué sistema operativo están trabajando? Si utilizan linux, asegurensé de tener seteados correctamente los permisos en las carpetas indicadas para la instalación del sistema (paso 4) http://documentacion.siu.edu.ar/wiki/SIU-Guarani/version3.11.0/instalacion_desde_cero/instalacion/gestion/linux, y si tienen habilitado Suhosin también verificar el paso 7 de la wiki http://documentacion.siu.edu.ar/wiki/SIU-Guarani/version3.11.0/instalacion_desde_cero/requisitos_previos/linux
Saludos y gracias,
Gabriela.