Cristian,
los combos en los filtros se pueden poner en cascada… pero solamente se permite tener un padre por ef, de manera de poder ir haciendo un filtrado jerarquico.
Es raro que tengas una situación en la cual necesitas tener dos padres no relacionados para poder elegir un filtro extra, incluso es raro a nivel listado… ya que tendria que estar filtrando por una tabla M:N para llegar a una situacion asi estimo.
Yo lo que haria sería intentar filtrar todo lo posible por uno de los padres y luego completaria el filtrado con el otro. Otra opcion es analizar si realmente el modelo requiere esa relacion M:N como intermediaria.
Saludos