El control de superposición horaria entre las comisiones que esta inscripto el alumno lo hace con cualquier comisión en la que este inscritpo ese alumno ya sea por la carrera en la que se esta inscribiendo para cursar y también con las materias de otras carreras que este cursando y que se haya inscripto.
Pueden probar correr ese control de superposicion horaria para esa comision que no debio dejarlo inscribir porque se superponia con los horarios de otra comision de otra carrera:
execute procedure sp_superphoraria( <ua> , <carrera>, <legajo> , <comision>);