Hola Elizabeth,
el liquidador de conceptos no distingue entre un concepto de jubilación de otro de obra social, trata a todos los conceptos por igual siguiendo los ciclos y subciclos de liquidación de los conceptos configurados.
Para el caso de liquidación de Ganancias se distinguen por la configuración que tiene cada concepto en el ítem de Retención 4ta. Categoría, ahí se configura si un conceptos es de tipo Jubilación u Obra Social o de otro comportamiento.
Espero haber podido disipar tu duda, sino me vuelves a consultar.
Saludos… Osmar