Hola! la verdad, ni en este contexto ni en otro trabajé con MP.
Pero te cuento cual es la idea.
El sistema te mostrará tu estado de cuenta (una cuenta corriente de cuotas, movimientos eventuales, y pagos). El saldo, sobre el que eventualmente se mostrarán punitorios.
Hasta ahí, nada raro con lo que podría hacer yo habitualmente.
Ese saldo, se debería poder pagar por MercadoPago, en una cuenta recaudadora.
De alguna forma debiera derivarte a MP, con los datos mínimos de referencia del pago, y el importe.
Una vez abonado (supongo directamente en la plataforma de MP), debería ver como enterarme que efectivamente se recibió un pago para la cuenta de la persona que miraba el saldo.
Gracias!