Bien, te pido hacer algunas verificaciones
1 - Volver a ejecutar la funcion del script enviado y ver si continuan los dos duplicados
2 - Esos dos duplicados no corresponden a proveedores extranjeros, no?
3 - Los duplicados tienen un segundo tipo y numero de documento asociado?
4 - Ejecuten la consulta asi y confirmar si siguen apareciendo los dos duplicados
SELECT replace(pd.numero, '-', ''), tdi.tipo_de_documento_de_identidad, count(*) as repeticiones FROM diaguita.anx_tipos_documento_identidad tdi
INNER JOIN diaguita.anx_personas_x_documentos pd ON tdi.tipo_de_documento_de_identidad = pd.tipo_de_documento_de_identidad
INNER JOIN diaguita.anx_personas p ON pd.persona = p.persona
WHERE (substring(pd.numero,1,2) <> '50' AND substring(pd.numero,1,2) <> '55' AND substring(pd.numero,1,2) <> '51')
GROUP BY pd.numero, tdi.tipo_de_documento_de_identidad HAVING COUNT(*) > 1
Gracias