Hola Kiko,
el tema de centralizar las instalaciones es independiente de la migración.
Tendrías que resolver este tema antes de comenzar a migrar.
Qué catacterísticas tienen esas instalaciones?
Manejan todas distintos tipos de documentos?
Si no es así habría que asignarle un nuevo número de cudap a los documentos de una instalación para unificarlos y mantener la numeración central, esto si es necesario mantener el historial de la documentación.
Contanos un poco y vemos como se puede resolver.
Saludos,
Eugenia