Hola Leandro,
La recomendación siempre es realizar las actualizaciones sin saltear las versiones de 2do dígito.
Principalmente en este caso, donde la versión 2.4 fue la ultima donde se utilizó el instalador/actualizador web.
La recomendación seria que actualicen primero a 2.4 con el actualizador web y luego actualicen a 2.5 con el actualizador por consola.
Cualquier cosa si tienen algún problema puntual en esas actualizaciones nos podrían pasar los detalles por GDS para analizarlo.
Saludos.