Hola Rodrigo
en la documentación de intalación thay un link sobre las variables de entorno que hay que configurar : https://documentacion.siu.edu.ar/wiki/SIU-Sanaviron-Quilmes/version2.0.0/variables.de.entorno.para.la.instalacion
En el sq.ini de sq-nucleo verifica luego esté bien configurado también.
saludos,
Ana María