Hola Martín, no es recomendable por razones de seguridad instalar el sistema en el directorio navegable de Apache. Nosotros recomendamos que sea en un directorio aparte, por ejemplo
/usr/local/proyectos/siu/kolla/4.5.0
Luego al final el instalador te va a mostrar una serie de comandos que deberías ejecutar para:
[ol]- Dejar publicado el proyecto (creación de link simbólico al toba.conf)
- Acomodar los permisos de archivos y directorios necesario para que el proyecto pueda ejecutarse correctamente[/ol]
Cualquier duda nos consultas.