Hola Hugo,
Hoy en día solo es posible vincular aplicaciones de tipo WEB, desde el concepto de su acceso/visualización. Es decir, agregarlo como ícono en Huarpe, contar con servicio de login centralizado (iniciar una sola vez la sesión).
A nivel arquitectura, arai-usuarios utiliza un backend de tipo LDAP, que permitiría integrar otro tipo de módulos externos y/o aplicaciones legacy que tengan la capacidad de autenticarse vía LDAP. Este sería el único camino posible para integrar apps externas.
Saludos!