Hola Juan,
El comando php -m te lista las extensiones para CLI (linea de comandos), PHP tiene dos archivos php.ini, uno para CLI y otro para FPM (Apache).
Hace una cosa, en la función ini de src/siu/operaciones/acceso/controlador.php agrega lo siguiente de manera temporal:
function ini()
{
phpinfo();
exit();
}
Luego revisa si esta cargada la extensión gd, adjunto captura.
Requisitos previos: https://documentacion.siu.edu.ar/wiki/SIU-Guarani/version3.20.0/instalacion_desde_cero/requisitos_previos/linux
Hilo que explica los diferentes php.ini: https://stackoverflow.com/questions/10665783/php-ini-which-one
saludos.
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