Dentro de una misma encuesta no puede haber dos preguntas con el mismo número, porque ese número se usa para establecer el orden de las preguntas. En distintas encuestas se pueden repetir los números, por supuesto.
Con respecto a la encuesta que ya tiene respuestas, solo vas a poder modificar la definición si eliminas todas las respuestas dadas, completas o incompletas de las tablas que guardan esos datos.