Que la encuesta inicie sin opciones seleccionadas para los componentes check y radio button es correcto, lo que no es normal es que no esté reconociendo las opciones seleccionadas. ¿Cómo es el mensaje que reciben? ¿es el pop-up con el aviso de error?
¿Esto ocurre con cualquier respuesta que seleccionen o solo con algunas?
¿En qué navegador(es) están trabajando?
Para agregarle la opción “vacía” a los combos pueden agregar este código:
$this->html .= "<option value='nopar'></option>";
en el archivo /php/encuestas/componentes/kolla_componente_combo.php justo antes del for que carga las opciones. Pero tengan en cuenta que esto no siempre es una solución.