Pensé que habían instalado Pilaga y Mapuche con su respectivo instalador en ambos entornos (desarrollo y producción).
Me confirmás entonces como está instalado Mapuche y Pilaga en cada entorno (me refieron a si usaron instalador del sistema o si instalaron un toba de cero y cargaron los proyectos)?
Efectivamente, si instalaron Toba pueden cargar varios proyectos, si lo instalan por instalador se crea una instancia de Toba por proyecto instalado usando el instalador.
Si ves el proyecto Arai en el toba editor y podes navegarlo es muy raro que no esté el registro en apex_proyecto, agregar el registro a mano no me parece la mejor solución, porque podrían estar faltando registros asociados en otras tablas.
Yo quitaría y el proyecto y lo volvería a agregar prestando atención a que no haya errores durante la ejecución del comando de cargar.
Seria un
toba proyecto eliminar -p arai
y luego
toba proyecto cargar -p arai
Pero antes de probar esto te pido me confirmes la pregunta del principio del mensaje sobre la instalación de cada uno de los sistemas en cada entorno.