Hola Agustín, creo que el problema puede estar en que estás perdiendo el valor el filtro.
¿Definiste una variable de sesión del tipo s__XXXX?
Fijate si la pusiste bien, porque recuerdo que una vez me pasó que, sin darme cuenta, sólo le puse un guión bajo (por lo cual no se creó la variable en la sesión) y se perdían los datos del filtro luego de refrescar el cuadro, por lo cual no mostraba nada al exportar los datos a xls o pdf.
Saludos