Hola Sonia,
ambos excel arrancan con un caracter de control en hexadecimal, en un caso se trata de A0 (Un LF) y en el otro un 20 (Comienzo de texto). Fijense en los archivos involucrados en la operacion si no les quedo algun enter o algun caracter en otro encoding fuera de los delimitadores de PHP, suele ser la causa mas comun en estos casos.
Saludos