Había un error al migrar el esquema de auditoria cuando se borraban tablas en el esquema de negocio, pero fue resuelto para la versión 3.10.0. Se me ocurre que quizás el switch no se completó correctamente y estás usando una versión vieja del comando ‘migrar_base’. Para verificarlo por favor ejecutá ‘svn st’ sobre la carpeta del proyecto Guaraní y adjuntanos el resultado.
Hola, restauré todo en un ambiente de prueba y lo resolví de la siguiente manera: instalé guaraní 3.10.2, apunte la base de datos a la de la 3.9.0, y ejecuté el comando ./guarani migrar_base, de esta manera se realizó correctamente la actualización.
Por alguna razón, cuando ejecuté el comando svn sw no avanzó hacia algunas carpetas interiores en el servidor que tenía la aplicación.