Lo mas recomendable es borrar los datos del archivo y crear la clave primaria.
Luego deberán recrear la información del araucano para que genere la procedencia.
Otra alternativa es poner procedencia=4. que significa que no se dispone de información.
Lo mismo les aconsejo regenerar la información para tenerla actualizada, al menos el año pasado que ya lo están pidiendo.
Yo tuve ese problema en casi todas las conversiones que hice, y mi solución fue borrar los datos de la tabla y generar la clave. Eran instituciones que casi no usan el Araucano, por distintos motivos. Se podría parchar el script poniendole el 4 en todas las procedencias null antes de generar la clave.