Buenos días Carlos.
Nosotros desde el siu hace varios años venimos trabajando con software libre. Puntualmente en la oficina de buenos aires todas las personas que laburamos aquí utilizamos el sistema operativo linux.
Algunos tenemos el ubuntu y otros se que tienen debian.
Esto nos trajo aparejado que no tengamos inconvenientes con ningún software ni nada por el estilo.
Volviendo al tema de kettle cuando armamos los trabajos y las transformaciones utilizamos la versión 7 o la 5.3, la hemos probado en ambas versiones y funciona correctamente.
Supongo que no tenemos inconvenientes ya que lo único que hacemos con la herramienta es correr querys o incorporar datos de un csv y esto funciona normalmente en ambas versiones.
Espero te sean de utilidad los comentarios.