Tuve un problema que cuando exportaba a Excel aparecían basuras de todo tipo, daba la sensación de que era un problema de encoding. Encontré el post en el foro que hablaba de esto y ya estaba cerrado. Por eso publico aquí. Les comento que mi problema no era por un archivo guardado en un enconding incorrecto sino que el problema era por un espacio luego del ?> de una clase. Hay que estar muy atentos de no dejar estos espacios en blanco (preferible que las clases no tengan etiqueta de cierre) porque son renderizados por php y pueden romper los archivos que se exportan.
Bueno, no escribo este mensaje pidiendo ayuda, sino para que quede como referencia para ahorrarle tiempo a alguien que tenga el mismo problema. Saludos!