Si. Se regenero “toba_guarani_pers”.
Cuando tenés el esquema de personalizaciones iniciado, pasas a trabajar con el esquema de personalizaciones, con lo cual los comandos “proyecto regenerar” y “proyecto exportar” exportan o regeneran los metadatos en el esquema actual con los metadatos originales (no los generados en personalizaciones/metadatos). De paso, aprovecho para recomendarte que uses el comando “guarani” para trabajar con SIU-Guarani en lugar de “toba proyecto” para evitar inconvenientes.
Básicamente, como “buena practica” hay que recordar que cuando se trabaja con el esquema de personalizaciones, para trabajar con los metadatos (exportar/regenerar) hay que ejecutar “guarani esquema_pers exportar/importar” y no “guarani exportar/regenerar” para evitar inconvenientes.
Te recomiendo que chequees la siguiente documentación: http://repositorio.siu.edu.ar/trac/Portal-G3/wiki/NotasTecnicas/ejemplopersonalbasic
(Especialmente, el párrafo introductorio y los links asociados)