No deberías tener problema en tener Gestión y Pre-inscripción corriendo bajo Apache 2.4.x en un mismo ambiente. Si bien, en la documentación de Pre-inscripción menciona que hay que tener la versión 2.2.x, nosotros tenemos algunos ambientes donde corremos ambos modulos bajo la 2.4.x y no encontramos inconvenientes aún.
En un futuro, cuando hayamos realizado pruebas más exhaustivas seguramente modifiquemos la documentación de requisitos sumando Apache 2.4.x.