Impresión de certificado de acuerdo al parámetro egr_configurar_ha

Hola
Estamos en la versión 3.20.0
Actualmente el parámetro egr_configurar_ha está configurado en NO para toda la institución.
Estaba haciendo pruebas de pasarlo a Si en entorno de desarrollo, al menos para una responsable académica que le vendría bien su uso, pero el tema es que a pesar de destildar alguna materia que el alumno tiene hecha de más, igual le muestra todas en el certificado.
Qué consideración debería tenerse en cuenta para que no salgan las destildadas?
Muchas gracias por la orientación!
Saludos
Iris