Buen día Paola,
Dejo algunos comentarios sobre cada uno de los inconvenientes que reportas.
Después de modificar el PATH pudiste visualizar los reportes correctamente?
Este error se da porque no se encuentra instalada la libreria Graphviz. Como podrás ver en la documentación se recomienda instalar la versión 2.26 o superior
Respecto a este error podrías chequear la respuesta que dio Sergio en este post y revisar la versión de java que tienen instalada.
Para verificar si diaguita se encuentra instalado y configurado correctamente con todas sus dependencias podrías utilizar la opción “Configuración SIU-Diaguita” que se encuentra en el menú Administración. Esta opción realiza el chequeo de las dependencias y las versiones requeridas por el sistema y te permite detectar si no se cumple algún requisito mínimo.
Podrías realizar este chequeo para ver si existe alguna otra dependencia o librería que falte instalar?
Saludos.