Hola tuve un problema al migrar entre versiones 1.4.9 y 2.1.1, el hecho es que me migro únicamente la carpeta metadatos del proyecto en la versión 2.1.1 y el resto de las carpetas www, php, etc no, por lo que tuve que copiarlos desde la version 1.4.9 para que funcione.
fijate que en el instructivo de migracion se menciona que hay que copiar (descargar) el codigo fuente del proyecto en la nueva instalacion antes de realizar la migracion.